In der »Mega Man Zero / ZX Legacy Collection« stecken einige Grafikfilter für die Spieler. Zudem warten eine Menge Artworks und Concept-Arts darauf, freigeschaltet zu werden.
Eine größere Erweiterung ist der Z Chaser-Modus. In diesem Modus muss der Spieler die Level so schnell wie möglich beenden. Den Modus können wir sogar mit einem Freund im Split-Screen-Koop abschließen.
Eine weitere Neuerung ist der Checkpoint-Modus und ein »Gelegenheitsspieler-Modus«. Wie der Name schon sagt, sind im Checkpoint-Modus überall in den Leveln Checkpoints vorhanden, sodass der Spieler nun das Level nicht mehr von vorne bestreiten muss, sollte er sterben. Eine bestimmte Anzahl an Leben gibt es nun auch nicht mehr, man kann quasi so oft sterben, wie man möchte.
Im »Gelegenheitsspieler-Modus« können wir nicht durch einen Sturz sterben, sondern werden zu der Stelle zurückgesetzt, an der wir gesprungen sind. Außerdem wird hier der erhaltene Schaden reduziert. Dieser Modus ist perfekt für Neueinsteiger.